Budynek terminalu pasażerskiego MPL Kraków - Balice o rocznej przepustowości 1 mln. 300 tys. pasażerów jest w pełni klimatyzowany i przystosowany do obsługi osób niepełnosprawnych. Cały terminal pasażerski jest chroniony m.in. systemem telewizji przemysłowej, elektronicznym systemem dostępu, systemem p. pożarowym a strumienie pasażerów przylatujących i odlatujących są od siebie oddzielone dla ruchu krajowego i międzynarodowego.

CZĘŚĆ OGÓLNODOSTĘPNA
Na parterze znajduje się hall główny ogólnodostępny z bankiem, stanowiskami rent a car i biurami wymiany walut oraz barki przekąskowe i stanowisko odbioru bagażu zagubionego. Znajduje się tu również 21 stanowisk odprawy biletowo-bagażowej jak również kasy biletowe oraz punkt informacji lotniskowej i turystycznej, przy którym w automatach można nabyć bilety komunikacji miejskiej oraz koleji. Na I piętrze części odlotowej znajduje się hall odlotów krajowych, 2 1 stanowisko kontroli bezpieczeństwa oraz odprawy dokumentów. W bezpośrednim sąsiedztwie hali odlotów krajowych usytuowano bar szybkiej obsługi prowadzony przez firmę Lot Catering, biura linii lotniczych. Na antresoli zlokalizowana jest restauracja, biura turystyczne, sklepy z pamiątkami i upominkami, salonik prasowy, stanowiska odbioru dokumentów podróżnych na loty czarterowe, pomieszczenia służbowe Urzędu Celnego, pomieszczenia dla załóg lotniczych, kaplica, punkt sanitarny, pomieszczenie dla matki z dzieckiem, plac zabaw dla dzieci, toalety. Na II piętrze zlokalizowano pomieszczenia służbowe , socjalne i szatnie Urzędu Celnego i Straży Granicznej, pomieszczenia techniczne, klimatyzatornie, centralny UPS i pomieszczenia teletechniki.

ODLOTY
Na parterze znajduje się strefa odprawy dla pasażerów odlatujących w ruchu międzynarodowym, 4 stanowiska kontroli bezpieczeństwa, 4 stanowiska odprawy paszportowej (dokumentów), punkt kontroli celnej oraz hala odlotów z kawiarnią Voyage, barkiem kawowym ze słodyczami, perfumerią sieci EuroShop, sklepem Baltona oraz Salonem Executive Lounge. Hala odlotów krajowych ze stanowiskiem kontroli bezpieczeństwa oraz odpraw dokumentów znajduje się tymczasowo (do zakończenia rozbudowy) na antresoli budynku terminalu.

PRZYLOTY
Na parterze znajduje się strefa odprawy paszportowej i celnej dla pasażerów przylatujących, 6 stanowisk odprawy paszportowej, sala odbioru bagaży wyposażona w 2 taśmociągi bagażowe o łącznej długości 110 m. Pomieszczenia służb celnych i paszportowych, bagażownia dla przylotów oraz toalety.